Bem próximo ao Mercado Público está o prédio da Antiga Alfândega, importante patrimônio histórico de Florianópolis. De aparencia sóbria e com bom equilíbrio de proporções, é considerado um dos melhores exemplos da arquitetura neoclássica da capital catarinense. Foi inaugurado em 1876, pelo então presidente da província, Alfredo D%39Escragnolle Taunay.
O local levou dois anos para ser construído, em substituição à sede anterior da Alfândega, incendiada em 1866 por causas até hoje desconhecidas. Sua desativação aconteceu em 1964, com o fechamento do Porto de Florianópolis, vindo a ser restaurado 13 anos mais tarde. Em 1984 passou por novos reparos. Hoje na parte superior do prédio funciona a 11ª Coordenadoria Regional do Instituto Brasileiro do Patrimônio Cultural. No térreo fica a galeria da Associação dos Artistas Plásticos de Santa Catarina e uma loja de artesanato que chega a receber até mil pessoas por dia durante o verão.